Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5934D3Z4U6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm5934D3Z4U6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm5934D3Z4U6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5934D3Z4U6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms