Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc8D3YZV8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms