Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pnldc1B2RXZ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms