Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabrr3B2RXA8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms