Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp42B2RQC2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms