Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H60cB1B213 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H60cB1B213 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms