Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a6B1AVK5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms