Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ism1A2ATD1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms