Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramel3A2AHA7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms