Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ambra1A2AH22 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms