Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myom3A2ABU4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms