Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef6A2A8M8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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