Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb4A2A863 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms