Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms