Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms