Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q2

Ighv5-9, Immunoglobulin heavy variable 5-9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv5-9A0A075B5Q2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv5-9A0A075B5Q2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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