Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms