Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Knop1Q9Z2Q2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms