Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdpk1Q9Z2A0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdpk1Q9Z2A0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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