Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z280

Pld1, Phospholipase D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld1Q9Z280 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pld1Q9Z280 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms