Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Thbs4Q9Z1T2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Thbs4Q9Z1T2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Thbs4Q9Z1T2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Thbs4Q9Z1T2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Thbs4Q9Z1T2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Thbs4Q9Z1T2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Thbs4Q9Z1T2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Thbs4Q9Z1T2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs4Q9Z1T2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms