Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z129

Recql, ATP-dependent DNA helicase Q1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RecqlQ9Z129 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RecqlQ9Z129 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms