Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms