Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Plod3Q9R0E1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms