Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms