Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms