Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf11Q9QYK7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms