Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms