Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Kcnip3Q9QXT8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Kcnip3Q9QXT8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Kcnip3Q9QXT8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Kcnip3Q9QXT8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Kcnip3Q9QXT8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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