Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Thsd1Q9JM61 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Thsd1Q9JM61 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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