Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkd2l2Q9JLG4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms