Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms