Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk3aQ9JKX8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms