Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
AtrQ9JKK8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms