Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms