Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms