Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms