Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms