Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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