Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apbb2Q9DBR4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apbb2Q9DBR4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms