Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmbim4Q9DA39 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms