Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco2Q9DA21 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms