Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Subh2bvQ9D9Z7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms