Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms