Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capns2Q9D7J7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Capns2Q9D7J7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Capns2Q9D7J7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Capns2Q9D7J7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Capns2Q9D7J7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Capns2Q9D7J7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Capns2Q9D7J7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capns2Q9D7J7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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