Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms