Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms