Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zcchc13Q9D548 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zcchc13Q9D548 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zcchc13Q9D548 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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