Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Ccdc7Q9D541 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7Q9D541 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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