Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3404Q9D506 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3404Q9D506 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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